Oltre agli esemplari in esposizione al pubblico, i musei naturalistici conservano numerosi reperti ai quali normalmente i visitatori non hanno accesso. Questo patrimonio non viene esposto per diverse ragioni, legate alle modalità di preparazione, alle necessità di conservazione e ad opportunità didattica, oltre che per eventuali motivi di spazio, ma è a disposizione della ricerca scientifica per la quale costituisce una risorsa insostituibile.
Le collezioni zoologiche del Museo di Storia Naturale di Milano sono visitate e studiate da ricercatori provenienti da tutto il mondo.