Santafereño de nacimiento y bartolino de formación, Miguel Isla se recibió de bachiller y de maestro en Filosofía por la Universidad Javeriana. Entrado en la Orden de Hermanos de San Juan de Dios, siguió allí los estudios de Medicina. Para 1772, cuando obtuvo licencia para ejercer, tenía casi una década de cultivar dicha ciencia con el médico José Celestino Mutis.
Inauguró la cátedra de Medicina en el Rosario, el 21 de octubre de 1802. El catedrático sustituto Vicente Gil de Tejada lo sucedió al morir, en 1807.