Obraz umieszczony w zegarze astronomicznym z 1574 r. to dzieło Tobiasa Stimmera (1539–1584), wykonane w oparciu o domniemany autoportret astronoma, dostarczony artyście z Gdańska przez Tiedemanna Giesego. Portret ten uważany jest za zaginiony, a powstać miał w latach 1503–1509. Mikołaj Kopernik, jako świeżo upieczony medyk na początku XVI w., został ukazany na portrecie z konwalią w dłoni oraz inskrypcją potwierdzającą, że obraz powstał na podstawie autoportretu: „ex ipsius autographo depicta”. W dole obrazu artysta umieścił cyrkiel, kulę, ostrosłup i księgę. Według przeprowadzonych przez prof. Józefa Flika badań, widniejący w zegarze portret „o miernej wartości artystycznej”, nie mógł być dziełem Tobiasa Stimmera. Badania rentgenowskie wykazały, że oryginalny portret strasburski przemalowany został najprawdopodobniej podczas remontu zegara, który przeprowadzony był w XIX w. Inspiracją przemalunku miała być tak zwana kopia paryska „toruńskiego portretu Kopernika” pochodząca z 1735 r.