La pintura Les llàgrimes de sant Pere, junt amb Magdalena penitent, del mateix autor, formaven part de la col·lecció que el banquer Pau Bosch tenia a Madrid. Ambdues van ser adquirides per Santiago Rusiñol (Barcelona, 1861 – Aranjuez, 1931) a París, el 28 de gener de 1894, per indicació del seu amic Ignacio de Zuloaga, amb la mediació del pintor Laureà Barrau, que feia d’intermediari.
L’adquisició d’aquestes dues teles va ser molt important, tant per l’efecte que va tenir en la revaloració de la figura i l’obra d’El Greco (Creta, 1541 – Toledo, 1614), impulsada pels artistes modernistes, com per la influència que va exercí en la pintura del mateix Rusiñol. Com a exemple, destaca la utilització del color groc del mantell de Sant Pere, en els cobrellits dels quadres La morfinòmana i Rêverie, pintats uns mesos després per Rusiñol.