El Museo de América fue fundado en 1941, sin embargo sus colecciones son mucho más antiguas ya que pertenecen a la colección Real. Parte de ellas fueron reunidas en el Real Gabinete de Historia Natural creado a mediados del siglo XVIII con los hallazgos de las primeras excavaciones arqueológicas y objetos etnográficos recogidos en las expediciones científicas y los viajes de exploración.
Estas colecciones fueron entregadas en 1868 al recién creado Museo Arqueológico Nacional y fueron incluidas en su sección de etnografía. Desde entonces, y a lo largo de los siglos XIX y XX, se realizaron compras y donaciones, incluyendo importantes colecciones prehispánicas de diferentes países de América. A partir de la década de 1940 se construyó una importante colección de arte colonial hispanoamericano.
El Museo reúne extensas colecciones procedentes de las diferentes culturas del continente americano. Esto nos permite admirar elementos únicos y también apreciar la capacidad de los pueblos americanos para desarrollar diferentes estrategias vitales, manifestadas aquí en diferentes universos simbólicos, a menudo cargados de un fuerte mestizaje.