En 1804, un décret napoléonien décrète la transformation de l'abbaye en prison. 10 ans d'aménagements transforment le lieu, et, en 1814, les 200 premiers prisonniers arrivent : hommes, femmes et enfants. En 1850, les femmes sont transférées à la prison de Rennes tandis que les enfants vont à Roiffé. La maison centrale de Fontevrault comptera jusqu'à 2700 détenus pour 48 gardiens, et fermera en 1963.
En 1955 a lieu une triple évasion à la maison centrale de Fontevrault. Le journal "Le Détective" relate les évènements à la manière d'une véritable enquête policière. En couverture, l'un des détenus, Georges Damen, qui ne goûta pas à la Liberté puisqu'il se fractura la jambe en escaladant un mur.