El manglar es el ecosistema de las Islas Molucas. Se trata de un ecosistema muy especial pues en él se unen el agua dulce y el agua salada. En él se encuentra el mangle (“árbol retorcido”) que protegen las costas de la erosión de tormentas y temporales y son grandes aliados contra el cambio climático ya que retienen mucho CO2. Muchos peces utilizan las raíces para refugiarse y como zona de cría. En este ecosistema se pueden encontrar muchas especies de peces cirujano, mariposa, tiburones nodriza y rayas.