Références aux travaux scientifiques de Louis Pasteur dans la crypte néo-byzantine, oeuvre de Charles-Louis Girault.

Les murs de la croisée du transept sont recouverts de deux panneaux de marbre où sont gravées les grandes découvertes réalisées par Louis Pasteur.
Ici sur le mur gauche : 1848 Dissymétrie moléculaire, 1857 Fermentations, 1862 Générations dites spontanées, 1863 Etudes sur le vin, 1865 Maladies des vers à soie.

Louis Pasteur, décédé le 28 septembre 1895 à Marnes-la-Coquette, repose dans une chapelle funéraire de style néo-byzantin, la Crypte, au cœur de l’Institut Pasteur.
Louis Pasteur eut des funérailles nationales mais son épouse, Marie Pasteur, refusa que Louis Pasteur soit inhumé au Panthéon.
Une Crypte fut donc édifiée, œuvre de l’architecte Charles-Louis Girault, du mosaïste Auguste Guilbert-Martin et du peintre Luc-Olivier Merson.
Cette chapelle offre notamment, au travers de magnifiques mosaïques polychromes, un regard sur les découvertes de Louis Pasteur.
Marie Pasteur y sera inhumée en 1910.