Zur gleichen Zeit mit dem Westchor und dem Zyklus der Stifterfiguren entstanden auch die prächtigen Glasfenster, die sich stilistisch und programmatisch in die Arbeit der Naumburger Werkstatt einfügen. Die deutliche Korrespondenz der Heiligen in den Scheiben zur Gestaltung einzelner Stifterfiguren lässt den Schluss zu, dass die Glaswerkstatt unter dem unmittelbaren Einfluss des Naumburger Meisters stand. Aufgrund der qualitätsvollen technischen und künstlerischen Ausführung zählen die Westchorfenster zu den bedeutendsten Glasmalereibeständen des Hochmittelalters.