Schaffhausen is een stad in Zwitserland, aan de Rijn. Het is de hoofdstad van het kanton Schaffhausen en telt volgens de gemeentelijke website 35.248 inwoners. De stad is bekend van de grootste waterval van Europa: de Rheinfall die enkele kilometers stroomafwaarts is gelegen.
De stad heeft een goed bewaarde binnenstad met de Munot-burcht.
Op 1 april 1944 werd Schaffhausen per ongeluk gebombardeerd door de United States Air Force vanwege een navigatiefout.