Kundus ist die Hauptstadt der gleichnamigen Provinz Kundus. Sie befindet sich im Nordosten von Afghanistan im Tal des Zuflusses Kunduz zum Amudarja nahe der tadschikischen Grenze, rund 250 km nördlich von Kabul. In der Stadt leben im Jahr 2019 etwa 350.000 Einwohner. Kundus liegt auf einer Höhe von 397 m.
Die Region ist sehr fruchtbar und für Afghanistan ungewöhnlich grün. Das vom Kundus-Fluss durchflossene Tal ist an drei Seiten unmittelbar und an einer Seite mittelbar von hohen Bergen umgeben, den Ausläufern des Hindukuschs. Kundus verfügt über einen kleinen Flugplatz, den Flughafen Kundus.
Kundus wird seit der politischen ‚Paschtunisierung‘ Anfang des 20. Jahrhunderts hauptsächlich von Paschtunen bewohnt. Außer ihnen wohnen Tadschiken und Usbeken in der Stadt. Kundus ist das Zentrum der vier nordöstlichen Provinzen Kundus, Badachschan, Baghlan und Tachar.