アフガニスタン紛争とは、米国がアフガニスタンに侵攻した後、アルカイダの安全な活動拠点を奪うために、米国とその同盟国がタリバンを政権から追い出すことに成功した 、現在進行中の紛争である。当初の目的が達成された後、NATO加盟国を含む40カ国以上の連合国は、国際治安支援部隊と呼ばれる安全保障ミッションを同国に編成し、そのうちの一部のメンバーはアフガニスタン政府と同盟して軍事戦闘に参加した。紛争は主にタリバンの反乱軍がアフガニスタン軍や同盟軍と戦うもので、ISAF/RSの兵士や人員の大半はアメリカ人である。この紛争のコードネームは、米国では「不朽の自由作戦」、「自由の番人作戦」と呼ばれている 。
2001年の9.11同時多発テロの後、アメリカのジョージ・W・ブッシュ大統領は、当時アフガニスタンの事実上の支配者であったタリバンに、オサマ・ビンラディンの引き渡しを要求した。タリバンが9.11同時多発テロがオサマ・ビンラディンによるものであるという証拠の開示を求め、事実であれば第三国に出国させるとの返答を理由に、「不朽の自由作戦」が開始された。タリバンとその同盟国であるアルカイダは、アメリカ軍と、1996年からタリバンと戦っていた北部同盟によって、国内でほぼ壊滅した。ボン合意では、新たなアフガン暫定当局がハミド・カルザイをアフガン暫定行政長官に選出した。国連安全保障理事会は、新政権がカーブルを確保するのを支援するためにISAFを設立した。また、タリバン政権の終焉に伴い、全国的な復興が図られた 。最初の侵攻で敗北した後、タリバンはムラー・オマルによって再編成され、2003年にアフガニスタン政府に対する反乱を開始した 。タリバンやその他のグループの反政府勢力は、地方でのゲリラ的な襲撃や待ち伏せ、都市部での標的に対する自爆攻撃、連合軍に対する裏切り者の殺害など、非対称な戦争を繰り広げた。タリバンは、アフガニスタン政府の弱点を突いて、アフガニスタン南部と東部の農村地域で影響力を取り戻した。2006年以降、タリバンはさらに勢力を伸ばし、民間人に対する残虐行為にも積極的になっていった。ISAFは、村を「クリア＆ホールド」するための対反乱作戦に兵力を増強して対応した 。2007年から2009年にかけて、暴力行為は拡大した。2009年には兵力が急増し、2011年まで増加し続け、ISAFと米国の指揮下で約14万人の外国軍がアフガニスタンで活動した。2012年にNATO首脳は軍の撤退戦略を開始し、その後、米国は主要な戦闘活動を2014年12月に終了し、国内に残存兵力を残すことを発表した。2014年12月28日、NATOはアフガニスタンにおけるISAFの戦闘活動を正式に終了し、安全保障上の全責任をアフガニスタン政府に正式に移管した。