No século XVII, uma imagem de Santa Luzia encontrava-se no altar de São Pedro, acompanhada por Santa Apolónia de Alexandria. Um altar dedicado a Santa Luzia é referido na documentação do século XVIII, situado na nave à direita de quem entra na igreja. A jovem mártir estava acompanhada pelas imagens de Santo António e São Rodrigo, estando a sua festa a cargo da confraria dos pedreiros. Estes altares das naves são removidos no século XX durante a campanha de restauro pela Direção Geral dos Edifícios e Monumentos Nacionais, tendo a imagem sido transferida para o altar de Nossa Senhora da Silva, onde se encontra.