Una vez que se traspasa el vestíbulo, el visitante se encuentra con una enorme columna estratigráfica que es el auténtico eje vertebrador del museo. La columna implanta su base en la planta baja y asciende hasta la tercera planta de forma que los diferentes períodos tratados en cada piso coinciden con los estratos correspondientes en la secuencia estratigráfica.
La columna es una representación realista en tres dimensiones de un corte estratigráfico real. Por exigencias del guión, no obstante, se han realizado pequeñas modificaciones y se han debido añadir estratos correspondientes a las sociedades cazadoras-recolectoas y a las edades Moderna y Contemporánea que no se encuentran presentes en la exposición. En uno de los laterales, el que mira al vestíbulo, el visitante puede observar en pantalla múltiple un audiovisual que se proyecta en bucle (una vez después de otra continuamente), relativo al paso del tiempo. En la cara opuesta hay una representación gráfica de la propia columna donde se especifican los períodos correspondientes.
La investigación arqueológica tiene como objetivo el estudio y comprensión de los restos materiales de las sociedades del pasado.
Los yacimientos se forman por la acumulación progresiva de estratos de tierra procedentes de aportes naturales y de las actividades humanas. Con determinadas técnicas arqueológicas, se retiran estas capas, y se documentan los objetos hallados, para su estudio.